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单细胞一站式分析
云生信 · 单细胞专版
绘制单细胞tSNE图
单细胞数据绘制小提琴图
单细胞分析
单细胞的基因共表达及共表达基因相关性分析
slingshot对单细胞数据实现拟时序分析
单细胞细胞比例柱状图绘制及富集分析
MIA算法整合单细胞及空间转录组
单细胞指定通路表达分析step3
单细胞指定通路表达分析step2
单细胞指定通路表达分析step1
云生信 · 泛癌分析
泛癌热图和箱型图
泛癌中体细胞拷贝数变异分析图
泛癌中基因表达与肿瘤客观缓解率ORR的相关性分析
多基因单通路的泛癌GSEA富集分析
泛癌感兴趣得分计算及预后分析
泛癌中感兴趣基因集富集得分连线图绘制
泛癌中特定通路基因的突变分析
感兴趣基因泛癌预后KM+Cox分析
云生信 ·通路分析
计算某感兴趣得分并计算该得分与致癌通路相关性
通路聚类分析热图
GO富集通路热图及相关性饼图绘制
逆累计分布函数识别显著通路
从差异基因筛选关键通路
云生信 · 机器学习
机器学习CoxBoost算法构建模型
机器学习superc算法构建模型
机器学习Enet算法构建模型
机器学习plsRcox算法构建模型
xgboost机器学习算法进行特征选择
机器学习Ridge算法构建模型
基于多种机器学习算法选择最好的模型
云生信 · 免疫专版
单样本富集算法分析免疫细胞浸润丰度
计算64种免疫细胞相对含量及可视化
预测某样本亚型对免疫治疗的响应step3
预测某样本亚型对免疫治疗的响应step2
预测某样本亚型对免疫治疗的响应step1
panImmune免疫浸润分析
免疫表达和肿瘤免疫环境富集分析
450K甲基化数据的免疫浸润分析
850K甲基化数据的免疫浸润分析
基于基因表达谱估算样本免疫基质评分和肿瘤纯度
基于ImmuneSubtypeClassifier进行肿瘤免疫亚型分类
构建免疫基因对分析工具
计算tcga突变细胞免疫得分
GSEA算法鉴定免疫相关的lncRNA
免疫浸润样本分类
鉴定肿瘤免疫浸润相关lncRNA
基因与免疫浸润相关性分析
云生信 · 预测模型
lasso回归模型筛选特征基因
cox回归筛选预后标记基因构建评分模型
自动化绘制套索算法回归模型图
基于预后生存和临床评价模型的一致性
DALEX残差分析进行模型评估
逐步回归法筛选基因构建Cox风险模型
DCA分析进行临床诊断和临床决策
经验贝叶斯SVM筛选疾病亚型基因
mRMR算法构建预测模型
利用cox模型筛选基因重要性
Lasso回归模型建立及变量筛选
贝叶斯年龄-时期-队列预测模型
高斯混合模型聚类AUC预测
非比例风险生存模型预后分析
比较不同分类模型一致性工具
云生信 · 服务器付费专享版
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癌症分类预测标志物特征提取的SVM-RFE
单细胞分析
SVM预后分析工具step1
SVM预后分析工具step2
SVM预后分析工具step3
CRISPR_TCGA_筛选关键基因
转录调控网络regulon活性分析
mRMR算法构建预测模型
随机森林的10折交叉验证
svm-rfe支持向量机的机器学习
通过测试集和训练集寻找好的基因集合分析
预测某样本亚型对免疫治疗的响应step3
预测某样本亚型对免疫治疗的响应step2
预测某样本亚型对免疫治疗的响应step1
云生信 ·药物敏感性专版
基因表达矩阵分析药物反应的敏感性
GSDC细胞系药物敏感性分析
cmap的方法进行药物预测
预测肿瘤样本药物敏感性分析
云生信 ·生存分析专版
对多组亚型数据进行生存分析
生存分析
生存分析风险计算
临床亚组生存分析
云生信 · 画图专版
circlize和弦图
相对丰度堆叠柱状图
circos圆环图
Scatter3d散点图
曼哈顿图
棒棒糖图
小提琴图和云雨图
多种PCA图的绘制
甜甜圈图
基因互作连线图
对比条形图及连线
气泡散点图和拟合曲线
描述性统计常用图(散点图柱状图和饼图)
山峦图
哑铃图及区域放大
圆角堆叠柱状图
mbio相关性热图
提取图片的色彩名称
quadran九宫格散点图
circVenn环状交集图
各种箱线图绘制
mantel-test相关性热图
三元相图绘制
热图和气泡图叠加图
箱线图和散点(组间组内差异分析)
scRNA差异基因热图
绘制多角图
venn图
基因转录表达与启动子甲基化相关性分析
绘制linkcor相关性图
基因位置的环形图
GDC网站pancancer突变数据可视化
突变综合性热图
Immunophenoscore分析
ggplot2绘制互作网络图
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根据kegg结果画多层富集图
绘制饼图
绘制带有生存信息的基因表达热图
PCA基因聚类图
多个热图绘制工具
pca图
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具有标记的时间柱状图
随机森林散点图
单基因互作网络图
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TMEboxplot图
韦恩图(ggVennDiagram)
元素对角化热图
dendrogram聚类树图
高级Volcanic map火山图
Calibration图
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fancybar条形图
gviz信号峰图
sigHeatmap聚类热图
转录因子cluster计算tumor index
supervisedcluster聚类图
Go聚类图
bsea气泡图
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GSEA热图
双线相关图
表达量热图
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按照自定义顺序绘制聚类热图
oncoPrint瀑布图
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差异基因表达箱型图
GO富集气泡图
聚类热图
质控箱型图
小提琴箱型图
针对多分组样本的转录组画热图
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pathwayscore热图
在LASSO降维后以RF方法对目的基因进行评估
风险因子关联图
post-hot分析图
物种丰度图
配对云雨图
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火山图
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相关性热图CorrelationHeatmap
列联表热图及Fishertest
双线火山图
基因家族聚类图
correlation圈图3
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correlation圈图1
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折线图一键绘制
云生信 ·春
基于表达信息挖掘与靶基因相关的基因
云生信 ·夏
人工神经网络ANN分析用于疾病诊断
RRA算法整合数据集
随机森林方法筛选诊断标志物
高通量数据样本相似性分析
基因富集分析
云生信 · 秋
绘制差异基因其在染色体上的分布
不同物种之间的同源基因名称转换
基于基因突变信息分析肿瘤突变负荷
基于甲基化数据评估肿瘤纯度及可视化
识别不同表型下的差异共表达关系
无监督聚类分析软件
线性判别分析筛选微生物biomarker
用GEO数据计算mDNAsi画图
云生信 · 迎新春
单因素方差分析(ANOVA)
双因素方差分析(ANOVA)
微生物群落泛化种和特化种划分
单因素方差分析Kruskal-Wallis检验
生物群落Raup-Crick指数计算
Hotelling独立样本检验
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两组间差异分析Wilcox秩和检验
双因素方差分析的非参数方法scheirer-Ray-Hare检验
生物群落NST计算
斯隆中性检验
生态位重叠指数
双因子生存曲线
ggClusterNet绘制共线网络
单个癌症患者中差异表达(DE)lncRNA的识别
ggbeeswarm包绘制蜂群图并做差异分析
scCNV多组CNV
scRNA_GO富集分析
两个列表合并
绘制双Y轴拟合曲线
PCA-UMAP和tSNE降维分析
基因在肿瘤与正常组织中的差异表达
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分组抖动散点图及差异分析
绘制Nomogram(诺莫图列线图)及Calibration校准曲线
多组数据回归分析的双向分面图
NGS数据时间序列分析(maSigPro)
肿瘤亚型中研究表达、甲基化、拷贝数变异的关系与分布
分类变量热图绘制
scRNA-DEG展示
circGroup多层分组环形图
MCPcounter结果进行分型
基因在肿瘤与正常组织甲基化分析
corRiskMut基因riskscore与突变相关性
组臂扩增和缺失分析
基于Spearman(斯皮尔曼)算法构建关联网络
依据表型数据无监督聚类算法进行分层聚类
基于线性建模方法对代谢组和转录组数据整合分析
基于多肽片段的新抗原和新抗原来源蛋白分析
基因组学基因名称修正分析
基于基因功能注释信息挖掘关键作用基因
基于细菌群落功能丰度结果进行差异功能分析及可视化
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GiViTI校准曲线绘制分析
mRMR算法构建预测模型
弹性网络筛选分类
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基因在物种之间表达的保守性分析
利用Cmap数据绘制热图
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随机森林降维分析确定最优签名
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Boruta算法降维分析
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利用ROC寻找最佳cutoff
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预后效果比较分析工具
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对不同分组tcga数据进行差异检验分析
多分组变量绘制散点图
根据gsea结果绘制多基因多样本相关性图
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ggunchull给ScRNA聚类加个圈
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单因素cox分析
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multilinearDE做差异表达分析热图
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DESeq2实现多组差异分析,数据标准化
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染色体上CNV分布
表型与突变相关性热图
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多元方差分析柱状图
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多肽片段的新抗原和新抗原来源蛋白分析
聚类热图
绘制聚类分组表达趋势功能注释组合图
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多基因mutual-exclusivity分析
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GEO数据集批次效应处理