分类: 云生信学生物信息学
强力推荐!HiC-Pro + homer实现三维基因组AB区室分析
大家好,小果又跟大家见面啦!这次小果给大家分享三维基因组的AB区室分析的内容 以防小伙伴们跟不上小果的节奏,小 […]
分子可视化工具Pymol速通指南(二)
上面在分子可视化工具Pymol速通指南(一)中,小果带着大家简单了解了Pymol是什么以及从PDB网站中下载蛋 […]
分子可视化工具Pymol速通指南(一)
最近小果在分析蛋白质分子结构的时候,有同学在询问,为什么我的蛋白质分子结构能以三维形态,或以更多不同的形态展现 […]
三分钟!HiC-Pro带你跑完Hi-C分析流程
Hello大家好,小果又来啦 小果今天使用HiC-Pro给大家分析一下Hi-C的数据 首先熟悉三维基因组的小伙 […]
强力推荐!Juicer处理Hi-C数据
Hello,大家好,小果又跟大家见面啦! 大家对Hi-C了解多少呢?这里小果首先给大家简单介绍一下Hi-C。H […]
欢迎来到ggplot2的世界——堆叠柱状图
今天小果用ggplot2绘制了基因表达量的堆叠柱状图,顾名思义,堆积柱状图,是每组的数据都堆叠在同一条柱子上。 […]
强力推荐!Higlass可视化contact矩阵!
小果最近研究三维基因组并且已经得到了contact矩阵(cool文件),那么怎么做出来美观的可视化图呢,像下面 […]
GEO芯片注释缺少基因注释信息咋办?不慌!小果教你重注释
今天小果在下载一个GEO数据集的时候发现该芯片平台注释信息不全,没有相关的基因注释信息只有探针信息,没有基因注 […]