年度归档： 2024年
sratools：一站式解决 SRA 数据下载、转换和分析问题
大家好，我是小果，今天我要给大家介绍一个超级好用的生信小工具，叫做sratools。sratools是什么呢？ […]
数据处理的命令太复杂了?来看看数据巫师datawizard
数据处理是我们作为生信研究人员最重要也是最麻烦的一步，R包千罗万象，要求的格式也是五花八门的，有经验的小伙伴应 […]
敲黑板了！！小果教你通过ssGSEA算法评估肿瘤免疫浸润程度！！！
小伙伴还在为免疫细胞浸润分析而困扰吗，是否不知道如何去做免疫浸润分析，有时候面对单样本的基因集却不知道如何分析 […]
拟时序分析不会做？R包Monocle3来解决
今天小果来为大家介绍细胞拟时序分析以及如何使用monocle3做细胞拟时序分析。 那么什么是细胞拟时序分析呢？ […]
绚丽降维之旅：Rtsne和umap带你探索基因数据的降维秘密！
你知道吗，有两个R包实现了t-SNE(t-distributed stochastic neighbor em […]
三分钟学会用ggpairs绘制相关矩阵
ggpairs（）简介 在学习ggpairs之前我们可以先来欣赏一下这个包绘制的图形如下， 每对数值变量的散点 […]
用R语言包GSVA，将数据转化为样本与基因关联矩阵，帮助你更直观且高效的分析
在生物学研究中，高维基因表达数据的分析是一项重要且挑战性的任务。为了揭示基因表达在不同生物学过程中的潜在功能和 […]
超详细，小果带你用beeswarm画优雅的散点蜜蜂图分析基因与临床相关性
大家知道基因与临床数据之间的相关性分析层出不穷，并通过可视化手段将分析结果展示出来，今天小果带给大家一个bee […]
药物分子设计part3：看这一篇就够了！全网最详细分子对接教程！（上）
小伙伴们大家好，在之前的分享中小果详细地给大家介绍了小分子配体的准备和蛋白结构的处理，那么这一次小果就给大家带 […]
从小白到空转达人：小果教你用Scanpy包玩转前沿热点空间转录组分析！
大家好呀，我们又见面啦，今天和大家聊聊单细胞和空转分析中一个很基础的包——Scanpy，Scanpy 是一个P […]