月度归档： 2024年1月
超简单！使用spaceranger做空间转录组分析
今天小果带大家使用spaceranger进行空间转录组的分析。 空间转录组简介 传统的单细胞测序，是将细胞组织 […]
基因组大数据可视化和分析中的佼佼者 — R语言包pathview
R语言包Pathview是一个用于生物学数据可视化和分析的工具，主要用于在代谢通路和信号通路等方面的研究中可视 […]
sratools：一站式解决 SRA 数据下载、转换和分析问题
大家好，我是小果，今天我要给大家介绍一个超级好用的生信小工具，叫做sratools。sratools是什么呢？ […]
数据处理的命令太复杂了?来看看数据巫师datawizard
数据处理是我们作为生信研究人员最重要也是最麻烦的一步，R包千罗万象，要求的格式也是五花八门的，有经验的小伙伴应 […]
敲黑板了！！小果教你通过ssGSEA算法评估肿瘤免疫浸润程度！！！
小伙伴还在为免疫细胞浸润分析而困扰吗，是否不知道如何去做免疫浸润分析，有时候面对单样本的基因集却不知道如何分析 […]
拟时序分析不会做？R包Monocle3来解决
今天小果来为大家介绍细胞拟时序分析以及如何使用monocle3做细胞拟时序分析。 那么什么是细胞拟时序分析呢？ […]
绚丽降维之旅：Rtsne和umap带你探索基因数据的降维秘密！
你知道吗，有两个R包实现了t-SNE(t-distributed stochastic neighbor em […]
三分钟学会用ggpairs绘制相关矩阵
ggpairs（）简介 在学习ggpairs之前我们可以先来欣赏一下这个包绘制的图形如下， 每对数值变量的散点 […]
用R语言包GSVA，将数据转化为样本与基因关联矩阵，帮助你更直观且高效的分析
在生物学研究中，高维基因表达数据的分析是一项重要且挑战性的任务。为了揭示基因表达在不同生物学过程中的潜在功能和 […]
超详细，小果带你用beeswarm画优雅的散点蜜蜂图分析基因与临床相关性
大家知道基因与临床数据之间的相关性分析层出不穷，并通过可视化手段将分析结果展示出来，今天小果带给大家一个bee […]