每日归档： 2024年1月10日
分子可视化工具Pymol速通指南（一）
最近小果在分析蛋白质分子结构的时候，有同学在询问，为什么我的蛋白质分子结构能以三维形态，或以更多不同的形态展现 […]
三分钟！HiC-Pro带你跑完Hi-C分析流程
Hello大家好，小果又来啦 小果今天使用HiC-Pro给大家分析一下Hi-C的数据 首先熟悉三维基因组的小伙 […]
强力推荐！Juicer处理Hi-C数据
Hello，大家好，小果又跟大家见面啦！ 大家对Hi-C了解多少呢？这里小果首先给大家简单介绍一下Hi-C。H […]
欢迎来到ggplot2的世界——堆叠柱状图
今天小果用ggplot2绘制了基因表达量的堆叠柱状图，顾名思义，堆积柱状图，是每组的数据都堆叠在同一条柱子上。 […]
强力推荐！Higlass可视化contact矩阵！
小果最近研究三维基因组并且已经得到了contact矩阵（cool文件），那么怎么做出来美观的可视化图呢，像下面 […]
GEO芯片注释缺少基因注释信息咋办？不慌！小果教你重注释
今天小果在下载一个GEO数据集的时候发现该芯片平台注释信息不全，没有相关的基因注释信息只有探针信息，没有基因注 […]
三分钟！小果带你获得Hi-C的contact矩阵！
大家好，小果又来啦！这次带大家过一下Hi-C的数据分析流程 上图是Hi-C测序的原理图，大概可以分为一下几步： […]