每日归档: 2024年1月24日
SCP探索单细胞宇宙的魔法工具,加速生物信息学研究
在之前,小果为大家介绍了popsicleR这个令人惊叹的R包,它提供了从单细胞分析质控到细胞注释的整套流程。这 […]
三分钟绘制双曲线新型火山图-双曲线火山图
最近在很多的文章中出现了下图类似的新型火山图,其实原理就是,分别以原来的的阈值线为基准,画两个原始函数为y=1 […]
R语言包GenomicRanges带你五分钟快速处理基因组区间数据
GenomicRanges是R语言中一个强大而灵活的生物信息学包,主要用于处理基因组区间数据。在生物信息学领域 […]
R语言包generics教你快速通过函数简化并处理生物学数据
R语言包generics在生物学领域中发挥着重要的作用,提供了一种通用的方法来定义函数,使得用户可以在不同类型 […]
保姆级教程!!小果教你如何使用DAVID数据库并可视化结果!!!
小伙伴们在做GO功能富集和KEGG通路富集分析时候,遇见过很多困难,其中之一就是在用R做KEGG分析时候,KE […]
10×genomics单细胞测序分析(三)Loupe Browser数据分析探索
上期小果带大家介绍了Cell Ranger处理分析后输出的文件,并解读了网页版的结果报告。虽然从网页版的报告中 […]
10×genomics单细胞测序分析(二)Cell Ranger结果报告解读
小果上一期带大家进行了单细胞测序分析的实战教学。从环境搭建开始,到下载数据,跑通流程,最后成功输出了结果。这期 […]
10×genomics单细胞测序分析(一)环境搭建与Cell Ranger数据处理
10×genomics因其分选细胞效果好,通量高等优点已成为主流的单细胞测序平台。 小果上期对它的原理进行了介 […]
保姆级教程!!GEO数据集芯片数据的探针ID转换!!
小伙伴们得到GEO数据集原始数据后,发现密密麻麻的基因表达信息不知道从哪里下手。而且基因表达信息往往有很多我们 […]
两分钟带你快速使用R语言包proxy处理数据间的距离信息并进行生物学研究
R语言是一种广泛应用于数据分析和统计建模的编程语言,其生态系统拥有丰富的扩展包(packages),以满足各种 […]