月度归档： 2024年9月
大佬眼中的超级水刊NC照样出佳作！基于核投影的过滤算法 SiFT来揭示单细胞数据隐藏的生物属性
前言 天空一声巨响，大海哥闪亮登场！开始今天的分享之前，小伙伴们竖起耳朵听听大海哥的问题！单细胞基因表达谱的部 […]
伪时间概念与细胞的空间位置相结合，SpaceFlow助力揭示细胞的时空模式
前言 哈喽，朋友们又见面了！今天学习的过程初中被人工智能赋能了吗？小伙伴们都知道深度学习框架最近爆火，像我们熟 […]
终于整理好了！结合特征的单细胞嵌入R包SIMBA全套分析教程＋代码送给大家
前言 谈到单细胞分析，少不了的就是聚类！聚类！在聚类！！不幸的是，这些“以聚类中心”分析方法依赖于准确定义的聚 […]
单细胞测序分析还能怎么卷？Mellon带你了解单细胞分化过程中的细胞密度变化
前言 大海哥在群里看到小伙伴们对于生信分析到底还能不能发SCI讨论的热火朝天！很多小伙伴们@大海哥，想听听大海 […]
Nature Methods佳作！双注意力机制新型图神经网络SpatialGlue破译空间多组学的空间域
前言 听到很多小伙伴们抱怨生信分析发文章实在太难了！！卷完工作量卷新方法，卷完新方法卷新算法！实在是苦不堪言。 […]
拒绝审美疲劳，大海哥手把手教学Nature级别环形散点图！
前言 大海哥已经给大家分享了十几期的R包教程了，今天给大家换换口味。散点可谓是生信分析中可视化的常客，很多数据 […]
Nat. Methods首发 | CellRank 二代版本强势上线！新框架如何进行细胞轨迹分析？
前言 太无语了！最近很多同学向小果抱怨，刚刚学会怎么使用CellRank进行细胞轨迹分析，结果又更新了！小果为 […]
细胞通讯分析还在用Cellchat？真的OUT了！ICELLNET 你值得拥有！
前言 天苍苍，野茫茫，一天不分享小果心痒痒！今天跟着小果来看看细胞通讯又有什么新花样了！自从单细胞爆火之后，在 […]
空间转录组学数据处理只依赖R语言？让我们从scanpy开始，拥抱python吧！
前言 空间转录组学分析，是近几年的一个热点。相信小伙伴们对于seurat再熟悉不过了！但是seurat是基于R […]
scType的功能又双叒叕更新啦！反卷积算法为空间转录组细胞类型注释赋能！
前言 看到scType是不是有种似曾相识的感觉？没错，几个月前小云带着大家学习过这个R包，不知道大家对之前学习 […]