孟德尔随机化（MR）分析进行的如火如荼，有些团队甚至逮住MR分析把高分文章发到手软，看到这么火爆发文形势，你还能不心动？
MR分析能这么火、这么受临床医生青睐，有三大原因，一是：只需公共数据库分析、0实验验证、性价比高；二是：选题方向与临床问题、流行病学更相近、更适合临床医生以及公共卫生口的研究人员；三是：MR分析目前还比较新，整体发文量远低于常规生信，可选的分析方向更多，还有大片待开发的蓝海领域，所以更容易发高分。
那么针对如此形势，小云也准备开辟一个新的版块，每月汇总整理前一个月内发表的MR分析高分文章，给小伙伴们传递最新发文情况，咱们一起做到知己知彼，发文才能百战不殆~ 有想法、有兴趣做相关课题的朋友也可以扫码联系小云做思路设计/复现或定制生信分析哟，我们将提供最适合您的发文方案~
11月整体发文情况：从pubmed上搜索“Mendelian randomization”，可以看到11月MR分析共发文423篇，下面小云以10篇典型文章给小伙伴们展示下最新发文进展。
- 国人团队高分文章
1. 中南大学湘雅医院张乐教授团队：蛋白组学+药物靶点MR分析（IF=15.3）
- 题目：从血浆和脑脊液蛋白质组中确定缺血性卒中有希望的治疗靶点:一项多中心孟德尔随机化研究
- 研究背景：缺血性卒中(IS)逐年增多，病情严重，预后差，迫切需要新的、有效的和安全的治疗靶点。循环蛋白是有吸引力的治疗靶点，本研究旨在使用多中心MR方法，在血浆和脑脊液(CSF)蛋白中识别用于预防和治疗IS的潜在药理学靶点。
- 研究思路：首先通过MR评估734个血浆和151个脑脊液蛋白的工具变量与IS的因果关系，以确定预期的治疗靶点。然后，使用来自deCODE联盟和Fenland联盟的血浆蛋白数据，以及来自FinnGen群组、ISGC联盟和UKB的GWAS数据，使用荟萃分析对上述可能的药理学靶点进行了彻底的评估。然后通过使用多种技术的敏感性分析来确认MR结果的稳健性。最后，利用PPI网络来研究假定的药物靶标和治疗剂之间的关系。
2. 南方医科大学南方医院王玮教授团队：环境污染方向MR分析（IF=9.8）
- 题目：暴露于环境空气污染对癌症风险的因果影响:来自遗传学证据的见解
- 研究背景：空气污染越来越与癌症风险联系在一起。然而，空气污染和癌症风险之间的遗传因果关系仍然知之甚少。
- 研究思路：采用了孟德尔随机化(MR)方法进行了大规模全基因组关联研究，以阐明空气污染(氮氧化合物、二氧化氮、PM2.5、粗颗粒物和PM10)在18种特定部位癌症风险中的潜在作用。
3. 福建医科大学附属协和医院林立航、韩悦教授团队：双疾病方向MR分析（IF=9.3）
- 题目：特应性皮炎对皮肤癌风险的因果影响:一项双样本孟德尔随机化研究
- 研究背景：观察性和流行病学研究显示了特应性皮炎和皮肤癌之间相互矛盾的结果。此外，观察性研究容易受到反向因果关系和混杂因素的影响，无法解释真正的因果关系，特应性皮炎对皮肤癌风险的因果影响仍不清楚。
- 研究思路：基于欧洲血统的公共全基因组关联研究的汇总数据集进行了双样本孟德尔随机化分析以探讨特应性皮炎与皮肤癌(包括皮肤恶性黑色素瘤、皮肤鳞状细胞癌、基底细胞癌和光化性角化病)之间的因果关系。负方差加权法（IVW）被用作主要分析方法，MR–Egger和加权中值方法用于补充方差加权的结果，一系列的敏感性分析被用来确保因果关系估计的稳健性。
4. 北京大学第一医院张学智教授团队：肠道菌群方向，遗传相关性分析+MR分析（IF=12.2）
- 题目：肠道微生物群和虚弱:来自遗传相关性和孟德尔随机化的见解
- 研究背景：观察研究表明，肠道微生物群与虚弱有关。然而，这些联系是否是因果关系的基础还不清楚。
- 研究思路：肠道微生物组的汇总统计数据来自MiBioGen 联盟(N= 18,340)。虚弱的汇总统计数据来自GWAS的荟萃分析，包括UKB和TwinGene (N= 175,226)。使用连锁不平衡评分回归(LDSC)和孟德尔随机化(MR)评估遗传预测的肠道微生物组和虚弱之间的遗传相关性和因果关系。
5. 中南大学湘雅三医院阳国平、陆瑶教授团队：药物应用方向，观察性队列分析+MR分析（IF=9.3）
- 题目：非选择性β-肾上腺素受体阻滞剂的使用与帕金森病的风险：基于多个真实世界证据
- 研究背景：高血压患者发生帕金森病(PD)的风险较高，流行病学证据表明，多种抗高血压药物可能影响PD的发生和发展，但结果不一致。通过多源数据，作者试图确定特定的抗高血压药物类别是否会增加或减少帕金森病的风险。
- 研究思路：作者使用了一种混合方法，结合了4种方法研究非选择性β-肾上腺素受体阻滞剂使用对帕金森病的影响。首先，使用基于FDA药物警戒数据库(FAERS)中引起不良事件的报告进行了非比例分析，以探讨不同类别的抗高血压药物对PD风险的影响；然后基于FAERS的发现，进行荟萃分析和UKB数据库队列分析进一步评估药物使用与帕金森病的关系；最后，采用孟德尔随机化(MR)分析来验证药物靶点和帕金森病发生之间的因果关系。
6. 上海交通大学医学院附属新华医院范建高、赵健团队：代谢方向，MR分析（IF=9.3）
- 题目：基因预测的血浆氨基酸水平与代谢功能障碍相关的脂肪性肝病风险:一项孟德尔随机化研究
- 研究背景：新兴的基于代谢组学的研究表明，氨基酸代谢与代谢功能障碍相关的脂肪性肝病(MAFLD)风险之间存在联系；然而，是否存在氨基酸代谢在MAFLD发展中的病因学作用仍然未知。本研究的目的是评估循环中氨基酸水平和MAFLD风险之间的因果关系。
- 研究思路：使用全基因组关联研究(GWAS)的概要水平数据进行了一项双样本孟德尔随机化(MR)分析，以评估遗传预测的循环氨基酸水平与MAFLD风险之间的因果关系。在发现 MR分析中，使用了来自最大的GWAS (8434例病例和770，180例对照)的数据，而在复制MR分析中，使用了来自MAFLD GWAS(1483例病例和17，781例对照)的数据，其中MAFLD病例是通过肝活检诊断的。在MR主分析中使用Wald比率或逆方差加权(IVW)方法，在敏感性分析中使用加权中位数和MR-Egger回归分析。此外，还进行了保守的MR分析，将工具变量限制在那些直接参与氨基酸代谢途径的基因上。
- 国外团队高分文章
1. 英国伦敦帝国理工学院团队：双疾病方向，观察性分析+ MR分析（IF=24.3）
- 题目：哮喘和冠心病事件:一项观察性孟德尔随机研究
- 研究背景：观察性研究表明哮喘是冠心病(CHD)的一个危险因素，性别改变了这一风险，但它们可能受到方法学的限制。为了克服这些问题，作者采用了“三角测量法”，利用不同的方法和不同的潜在偏差来增强对研究结果的可信度。
- 研究思路：首先使用英国医疗记录进行了一项观察性研究，将哮喘患者按年龄、性别和全科医生(GP)操作与普通人群1:1匹配，通过应用最小充分调整测量哮喘和冠心病事件(心肌梗死:住院/死亡)之间的联系。然后使用来自UKB、跨国哮喘遗传联盟(TAGC)和CARDIoGRAM的数据进行了一项孟德尔随机化(MR)研究，以哮喘作为暴露，冠心病作为结局，选择与暴露（哮喘）相关的64个SNPs作为工具变量，通过反向方差加权（IVW）荟萃分析和调整多效性的方法来评估哮喘对冠心病的影响。
2. 哈佛大学联合南京医科大学团队：MR分析+转录组验证（IF=38.9）
- 题目：急性呼吸窘迫综合征相关基因谱和生物标志物的鉴定
- 研究背景：本研究的目的是描述急性呼吸窘迫综合征(ARDS)的遗传致病因素，并早期预测具有高ARDS风险的患者。
- 研究思路：通过对ARDS全基因组关联研究(1250例病例和1583例欧洲血统对照)和33，150个特征的汇总统计，进行了全表型孟德尔随机化分析，以探索与ARDS发展有潜在因果关系的遗传致病特征。然后利用来自临床前小鼠模型的肺组织转录组数据和人类血液转录组数据来验证4个关键生物标志物的表达，然后基于4个血液基因和5个免疫细胞比例进一步构建预测模型和列线图。
3. 美国范德比尔特大学团队：药物应用方向，MR分析（IF=13.8）
- 题目：噻嗪类利尿剂基因替代物与降低肾结石风险的孟德尔随机分析
- 研究背景：三十多年来，噻嗪类药物一直是预防肾结石复发的标准药物，这种实践建立在观察数据集和多个小型临床试验的基础上。然而，最大规模的随机临床试验未能发现噻嗪类药物对肾结石复发的保护作用，对其预防肾结石的功效提出了质疑。本研究旨在确定噻嗪类利尿剂的基因替代物与肾结石风险之间是否存在关联。
- 研究思路：使用孟德尔随机化方法评估噻嗪类利尿剂的基因替代物与肾结石风险的相关性。暴露为噻嗪类利尿剂的基因替代物，是与收缩压相关的噻嗪类敏感性氯化钠共转运体基因的遗传变异体，来自国际血压联盟(ICBP)的收缩压GWAS数据。主要结果是肾结石的发病率，来自百万退伍军人计划(MVP)、英国生物银行(UKB)和芬根研究(FinnGen) 的GWAS数据。噻嗪类利尿剂的基因替代物与肾结石的孟德尔随机化关联在每个队列中分别进行评估，然后在随机效应荟萃分析中合并。
4. 耶鲁大学联合多个大学团队：精神病学方向，遗传相关性+MR分析（IF=25.8）
- 题目：创伤后应激障碍症状的遗传易感性及其与心脏代谢和呼吸结局的相关性
- 研究背景：据报道，创伤后应激障碍(PTSD)是几种身体和躯体症状的危险因素。然而，PTSD的遗传学及其与医疗结果的潜在关联仍不清楚。本研究旨在从电子健康记录(EHR)中检查与PTSD多基因评分相关的疾病类别和实验室检查。
- 研究思路：这项遗传关联研究从2021年7月15日至2023年1月24日进行，使用了来自4个生物库参与者的EHR数据。PTSD症状严重程度的多基因评分(PGS-PTSD)使用BioVU、MGB、MGI和UKBB中所有可用的phecodes进行测试。PTSD症状严重性的多基因评分作为暴露，总共1680个phecodes(即，国际疾病分类)和2个生物库(BioVU和MGB)的490项实验室测试作为结果。对重要的医疗结果进行了超比例疾病类别检测，随后进行了遗传相关性和两样本MR检测，以确定遗传相关性。然后进行多变量MR评估PTSD与健康结果的相关性是否独立于体重指数和吸烟的遗传效应。
小结
本次汇总了10篇国内外团队的高分经典MR文章，涵盖了环境污染、精神疾病、双疾病、代谢、药物靶点研究等几个主流分析方向，赶快学起来~还在犹豫观望的朋友，脚步要快一点了，随着文章的爆发，高分文章的发文难度肯定会变大，尽早上车才好拿高分呀！想在以上方向上进行MR思路复现/设计或定制分析的朋友欢迎直接扫码联系小云，多种分析思路任君选择~
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