小果今天给大家推荐一个超好用的通路数据库——Reactome。
做生信怎能少得了通路分析呢？对科研领域来说，通路分析已成为公认的大家绕不开的环节，无论是发文章还是写本子。想必大家也一定听说过KEGG数据库。它声名显赫，是通路分析的武林盟主数据库。其由日本京都大学和东京大学联合开发，可以用来查询代谢途径、酶（或编码酶的基因）、产物等，也可以通过BLAST比对查询未知序列的代谢途径信息。
但是很遗憾武林盟主的服务是收费的，而且通路的图片不够漂亮很模糊。有点吃老本的感觉。这对我们科研人员来说十分不友好。
而Reactome数据库恰恰解决了这一痛点。它的发展速度非常迅猛，越来越多的科研工作者，改用Reactome，可谓是通路分析的令狐冲。
截至到写本文的时间，引用该数据库的信息如下。
背景雄厚，有武林八大门派的支持。
数据库网址
Home – Reactome Pathway Database官网
Home – Reactome Pathway Database (ncpsb.org.cn)亚洲地区访问会更快。
Home-Reactome路径数据库 (joaskin.com)中文版。
ReactomeFIViz – Reactome通路数据库 (joaskin.com)中文的帮助文档。
接下来跟小果去一探究竟吧
数据库首页
页面设计十分简洁，一目了然。中间是搜索框可以查找，反应蛋白质与通路。下方四个图标依次是代谢通路浏览器，分析数据，第三个是查找与癌症和其他类型疾病相关的通路和网络模式的功能，第四个是帮助文档。
搜索功能
小果以葡糖糖为例，试用搜索功能，输入葡萄糖后。
输出有多种类型的结果，Pathway通路，Reaction反应，Regulation调控，Chemical Compound化合物，Interactor，Complex复合物，Set，Protein蛋白质。几乎包括了所有关于葡萄糖的信息。
侧边栏具有物种，类型，胞内，反应类型等筛选方式。更精确的找到你想要的信息。
我们点入葡萄糖代谢进一步查看
代谢ID号码，物种，同义词，参与的反应，通路的描述，还有反应信息
下方还有不同物种的代谢反应。
通路浏览器
我们回到首页用通路浏览器，来查看该通路，打开通路了浏览器需要加载一会。
首先映入眼帘的是各种通路图。我们输入R-HSA-70326，葡萄糖代谢的通路ID。
接着就找到了它所处在的位置，其在碳水化合物的下面。
接着点击右上角相册图标，显示了具体的过程。
下面还有更详细的描述信息，代谢化合物，基因表达图。
还可以下载为各种格式的文件。
分析工具
分析工具可以输入我们的数据进行分析。我们以UniProt accession list为例。
接着选择Human.
就能得到代谢通路信息了。
参考文献：
Gillespie, Marc et al. “The reactome pathway knowledgebase 2022.” Nucleic acids research vol.
50,D1(2022):D687-D692. doi:10.1093/nar/gkab1028
好啦小果今天的介绍的就到这里了，我们下次再见ヾ(￣▽￣)Bye~Bye~
通路分析等其他分析内容欢迎尝试本公司新开发的云平台生物信息分析小工具，零代码完成分析，云平台网址：http://www.biocloudservice.com/home.html。
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参考文献：
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50,D1(2022):D687-D692. doi:10.1093/nar/gkab1028
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