1个免费工具，帮你对抗癌症？TISIDB就像肿瘤免疫的”谷歌地图”

你知不知道有一个数据库网站，在你想获取肿瘤相关的数据集或者做肿瘤免疫分析时可以大大减少你的工作量？今天小果就带大家认识一个专门用于肿瘤免疫分析的数据库网站，大家一起来和小果看一下吧！

初识TISIDB

TISIDB是2019年香港大学开发的一个针对肿瘤免疫学分析的多类型数据资源科研网站。那么TISIDB主要的应用有哪些方面呢？

1.手工整理近千个与抗肿瘤免疫相关的基因；

2.在线分析基因图谱和高通量筛选数据来鉴定与肿瘤细胞对T细胞介导的杀伤和免疫治疗的抗性基因；

3.针对30种癌症类型预测免疫功能与基因之间的关联。

研究分析方向

TISIDB网站主要有10个分析方向，那么具体有哪些呢？和小果一起来看一下吧！

1.功能；

2.文献；

3.高通量筛选；

4.免疫疗法；

5.肿瘤浸润淋巴细胞；

6.免疫调节剂；

7.趋化因子；

8.亚型；

9.临床；

10.药物。

接下来，小果针对这10个分析方向中的其中四个来给大家做简单的介绍，和小果一起来看一下吧！

功能

1.输入网址：[TISIDB官网]  http://cis.hku.hk/TISIDB/

1. 输入感兴趣的基因类型并点击submit：

1. 点击左侧进入返回的结果：

1. 基本信息：

1. 亚细胞定位信息：

1. GO和途径：

文献

除了可以查阅感兴趣目的基因的相关功能信息，我们同样可以通过TISIDB查阅基因与肿瘤免疫之间关系的相关文献哦。

1. 输入感兴趣的基因名称搜索；
2. 选择“literature”选项查看内容；

高通量筛选

同样地，我们还可以查看选择的基因在各种高通量筛选数据集中是否对T细胞介导的杀伤产生抗药性或增加敏感性。只要选择“Screening”选项即可查看具体内容哦！

免疫疗法

那么我们如何查看目标基因在具有免疫疗法的患者队列中，怎样对免疫疗法进行预处理的肿瘤活检的转录组学和基因组分析呢？只要选择“Immunotherapy”即可查看哦！目前，该网站收集了5个转录组和6个基因组数据集，一起和小果来看一下吧！

怎么样，TISIDB这个网站的基本功能你了解了嘛?

还有更多应用等着我们一起探索，更多肿瘤免疫分析相关工具请大家移步小果的云生信平台吧！

小果专属云生信平台：云生信  – 学生物信息学 (biocloudservice.com)

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