小果带你用GSEA算法鉴定免疫相关的LncRNA
长链非编码RNA（Long non-coding RNA，lncRNA）是长度大于200个核苷酸的非编码RNA，lncRNA可以通过多种方式调节免疫细胞的生长、分化、增值、凋亡等生物学过程，从而影响免疫细胞的功能。目前。已经有 很多研究表明，免疫相关的；lncRNA在肿瘤、自身免疫性疾病、感染性 疾病等方面发挥着重要作用。
GSEA（Gene Set Enrichment Analysis）算法是一种用于富集分析的方法，用于分析基因表达谱数据中的生物学通路、代谢通路或表观遗传学等基因集的富集情况，以揭示与不同生物学过程相关的基因集的功能特征。在研究免疫相关的LncRNA时，可以使用GSEA算法来分析差异表达的LncRNA基因集是否富集在免疫相关的基因集中。
和小果一起来看看小工具如何使用吧：
【应用场景】
对lncRNA做功能注释，也可以用于甲基化数据等。
双坐标轴图通常用来对比展示数据之间的变化趋势相关关系：
散点图 + 线性回归，展示3组数据的相关性
柱形图 + 折线图，像本篇例文这样，一个是数量，另一个是比例。
【上传数据】
Lnc_input.csv（A列表示不同类型的癌症，B与免疫相关的lncRNA的数量，C列表示所有的lncRNA的数量，D列表示所占比例）
【输出结果】ImmuLncRNA.pdf
该图展示了不同类型癌症中与 免疫相关的lncRNA的数量及所占比例。
今天的介绍就到这里啦，请持续关注小果，我们下期见~
GSEA算法鉴定免疫相关的lncRNA：www.biocloudservice.com/384/384.php
其他分析：云生信 – 学生物信息学 (biocloudservice.com)
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