小果手把手教你用miniconda安装EDTA（下）
书接上回，我们已经安装好miniconda，现在该安装EDTA了。 小果安装的时候一开始走了不少弯路，比如说试图通过以下代码来安装EDTA
#创建一个新的conda环境，并指定python版本
conda create -n bioinfo python=3.9
# 激活这个环境
conda activate bioinfo
#在bioconda channel下载edta软件包
conda install -c bioconda edta
结果总是报错！每次安装新软件都觉得自己是呆瓜的小果研究了半天，认为应该是环境依赖出了问题，但不会解决，搜寻网络各种教程后果断删掉了刚刚创建的环境，使用了另一种安装方式（(11条消息) EDTA 最简易安装方法_tesorter_Plaichat-123的博客-CSDN博客），很快成功了，感谢来自CSDN的馈赠~
conda remove –name bioinfo –all#删除名为bioinfo的环境
git clone https://github.com/oushujun/EDTA#在github上克隆（下载）EDTA项目
没有git？装！
sudo apt install git
装完git以后再次执行
git clone https://github.com/oushujun/EDTA
装好了！使用EDTA.yml继续创建命名为EDTA的conda环境。
conda env create -f EDTA.yml
conda info –envs#查看已安装的环境
conda activate EDTA#激活EDTA
conda create –name repeatmasker repeatmasker
#创建新的环境并安装RepeatMasker
conda install -c bioconda samtools#通过bioconda安装samtools
然后我们就可以注释基因组中的重复序列了，大概流程如下所示：
- 下载了小鼠的全基因组序列文件（.fasta）
- 下载小鼠的CDS序列文件（可以在gencode下载）
- 构建小鼠的repeat library
- 对小鼠全基因组序列进行重复序列注释（用到了RepeatMasker）
- 统计注释结果
小果下期分析详细的注释教程哦！不要错过~
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