血浆菜油甾醇和ABCG5/ABCG8基因位点与胆石症和胆囊炎风险的关系:来自孟德尔随机化和共定位分析的证据

发表杂志:Human Genomics

通讯作者单位:浙江大学医学院附属邵逸夫医院消化内科

研究目的

  • 胆石症是一种常见的肝胆疾病,其形成与胆汁中胆固醇的过饱和和结晶以及胆囊收缩力的降低有关。
  • 本研究旨在探讨血浆代谢物与胆石症/胆囊炎风险之间的因果关系,并确定潜在的治疗靶点。

主要结果

  • 孟德尔随机化分析显示,遗传预测的血浆菜油甾醇水平与胆石症和胆囊炎的风险呈负相关。
  • 双向孟德尔随机化分析表明,胆石症风险较高的个体血液中菜油甾醇水平较高。
  • 共定位分析确定了一个位于ABCG5/ABCG8基因位点的候选因果SNP rs4299376,该SNP与菜油甾醇和胆石症均相关。

主要方法

  • 本研究使用了来自加拿大纵向研究老龄化(CLSA)队列的8299名随机选择的、无关的欧洲血统个体的血浆代谢物测量数据和GWAS数据。
  • 对于孟德尔随机化分析,使用了FinnGen Round 9和UK Biobank的胆石症和胆囊炎相关性状的GWAS汇总统计数据。
  • 使用Wald比值估计效应大小,使用逆方差加权(IVW)作为主要的因果估计方法,并使用MR-Egger和加权中位数方法进行敏感性分析。
  • 使用coloc R包进行共定位分析,并使用locus zoom生成Locus zoom图。

创新点

  • 首次使用孟德尔随机化和共定位分析方法,探讨了血浆菜油甾醇和ABCG5/ABCG8基因位点与胆石症和胆囊炎风险之间的关系。
  • 确定了一个位于ABCG5/ABCG8基因位点的候选因果SNP rs4299376,该SNP与菜油甾醇和胆石症均相关,为胆石症的治疗提供了潜在的靶点。

缺点

  • 本研究仅使用了欧洲血统个体的数据,可能存在种族局限性。
  • 本研究未考虑其他潜在的风险因素,如饮食习惯、生活方式等。
  • 本研究未进行功能实验,无法确定ABCG5/ABCG8基因位点的具体功能。

后续研究

  • 进一步扩大研究人群,包括不同种族和地区的个体,以验证研究结果的普遍性。
  • 考虑纳入其他潜在的风险因素,如饮食习惯、生活方式等,以更全面地了解胆石症的发病机制。
  • 进行功能实验,确定ABCG5/ABCG8基因位点的具体功能,为胆石症的治疗提供更有力的证据。

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