远程Rstudio使用教程–初级版及常见问题答疑






远程Rstudio使用教程–初级版及常见问题答疑

小果  生信果  2023-02-10 19:00:27

小果这里简单阐述下普通用户如何使用Rstudio

背景:ubuntu 20.04服务器上安装好Rstudio

Rstudio版本:2021版本,R版本为4.2.1


Rstudio 哪里登录以及如何登录

在任意浏览器输入安装Rstudio服务器的IP和端口

端口默认是8787,(如需变更,需要配置对应的路由器,或者直接服务端配置即可,细节这里不阐述)

http://IP:端口/auth-sign-in?appUri=%2F

RStudio 登录后的界面是什么样子?

如图:


如何上传数据

图中圈出的 文件files–上传upload,然后弹出 upload files 就可以上传了


如何查看图片

如果是输出的pdf文档,可以直接点击,默认会在网页的新窗口弹出


如何下载数据

需要下载的文件前面打对勾,然后Files–More–export,弹出框–选择download即可。


不知道下载到哪里,可以通过查看网页浏览器下载记录即可。一般是保存到默认下载位置。


如何查看文档

如何查看txt文档或对应的R代码文档:

点击对应的文档,然后在左上方会展示对应的结果


常见问题:

Q:经常莫名其妙的报错:

检查所有的命令,是否输入完整,以及输入的字符都是英文格式, 以及引号是否正常,括号是否是英文格式等等,细节要检查到位。

Q:读取文件,提示找不到

getwd() #查看当前路径,有时候运行保存,路径需要和数据的位置一致才行。

setwd(“”)#更改路径,需要加引号

Q: 程序在运行中,过了一会自动退出了

Rstudio 默认1小时无任何操作自动断开,但后台还在运行。

如需取消自动退出,需要联系管理员,配置如下:

sudo vim /etc/rstudio/rserver.conf

添加

auth-timeout-minutes=0 #取消自动退出

auth-stay-signed-in-days=30  #30天内默认登录

Q:上传数据然后一直转圈圈传不上

一般是网络问题,数据太大的话建议使用第三方的FTP工具来进行,比如Filezilla等也支持断点续传。

Q:我想切换R的其他版本,不知道怎么操作?

Ubuntu 20.04下的Rstudio 一般不推荐切换,比较麻烦。特别是多人使用。无法做到用户1使用R3.6版本,用户2使用R4.2版本。

需要管理员权限,且在命令行界面操作。

推荐的解决办法:命令行模式下调用不同的R版本,比如putty或xshell登录后操作。

Windows下可以直接选择对应的安装R的路径即可。



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