Sequel IIe是什么鬼?做生信的你想知道吗?

比较项Sequel IIePacBioOxford Nanopore Technologies
平均读长约2-3 kb更长更长
数据质量高,错误率约0.1%数据质量稍差,但可通过多次测序和校正进行提高数据质量较差,需要进行信号增强和滤波等处理
价格较低较高较高
仪器体积较小较大较小
样品处理需要较高质量的DNA样品DNA/RNA样品均可DNA/RNA样品均可
读序速度较慢较快较快
应用场景基因组组装、转录组分析、基因识别基因组组装、转录组分析、基因识别基因组组装、转录组分析、基因识别
局限性和挑战错误率较低但仍存在错误,信噪比较低数据质量稍差,需要多次测序和校正数据质量较差,需要进行信号增强和滤波等处理

嘿!小伙伴们,最近有一个新技术,是关于一个叫做”Sequel IIe”的新一代测序技术的。这个技术是由Illumina公司推出的,跟PacBio公司的长读长度测序技术是竞争关系哦。Sequel IIe通过利用Illumina的”bridged amplification”技术,在单个DNA模板上生成成千上万个类似PCR扩增的”cluster”,然后对每个cluster进行并行测序。Sequel IIe比起PacBio的技术,数据质量更高,而且价格更低。这个技术产生的读长长度也比较长,并且错误率也不高。大家通过这个表格来了解下这个技术。