在样品a中，免疫基因A表达大于免疫

基因B，那么这个基因对在样品a中表达就为数字1；在样品b中，免疫基因A表达小于免疫基因B，那么这个基因对在样品b中表达就为数字0。这种方法可以用于分析不同样本之间的差异，从而找到与某种疾病相关的免疫基因对。

筛选免疫基因对有什么快捷的办法吗？这就是小果今天要介绍的小工具了。

上传数据

在构建之前，我们需要以下数据：

1. surv.txt（样本生存信息）

2. genes_IRIS.txt（免疫基因的相关信息）

3. tpm.txt（基因表达矩阵）

输出结果

output_km_screening_of_gene_pair.txt（基因对文件并做检验）

注：其中IRGP表示免疫基因对，logrank.p是指在生存分析中进行组间比较时，计算得出的log-rank检验的P值。P值是用来评估这种差异是否显著的指标，P值越小表示差异越显著。FWER指的是“family-wise error rate”，即家族普通误差率，是一种多重比较校正方法。在进行多个假设检验时，由于进行多次比较，有可能会出现假阳性（Type I error）的问题。FWER校正方法可以控制该概率在一个预先设定的水平内，如0.05或0.01。

今天的介绍就到这里啦，请持续关注小果，我们下期见~

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