赢麻了,“中医药”机制研究So easy!线粒体、细胞凋亡、缺氧与代谢组四重奏,成都中医药大学一区Top模板!






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小途  生信果  2024-05-23 19:00:28

小伙伴们好啊,又到小途分享优秀文章思路的时间了。最近有粉丝留言,提到中医药相关的机制实验该怎么做?其实小途觉得中医药的难点更在于有效成分的筛选和验证,至于机制实验,小途也有几点不甚成熟的想法,供大家参考。
1,从疾病的发病机制入手,这是最常用,最靠谱的首段。现代医学研究这么多年,一般的疾病都能找到具体对象,具体表型,比如疾病的发生是伴随着巨噬细胞极化、T细胞铁死亡等等;
2,从基础研究的热度入手,如果对创新性要求高,那么这条是首选。比如,早期我们做细胞凋亡、中间出现细胞自噬、现在又有了铁死亡/铜死亡/双硫死亡/免疫原性死亡。。。
(1)有的小伙伴担心,这样有蹭热点的嫌疑。小途的想法是,蜻蜓点水、猴子掰玉米,那才是蹭热点,我们是选定一个点持续来做,是合理的跟随当前研究动向,哈哈。
(2)又有小伙伴说了,那怎么确保铁死亡/铜死亡/双硫死亡在我这个疾病里有参与了?其实,小途也不能保证,但是生物体是非常复杂的,一个临床现象,可以从很多种基础的角度来解释。再说了,不拼一把,没有任何风险,那人人都知道的东西,创新性又如何体现出来。
3,从性价比/成功率/现实中相对薄弱的理论基础等多个角度来讲,高通量测序是首选思路。说白了,我不纠结铁死亡/铜死亡/双硫死亡到底是哪一条,一个转录组测序,哪个有差异就是哪个,这何乐不为了,是吧。现在转录组测序几百块钱,这么便宜,随便找个信号通路,买个WB抗体还好几千,如果条带没出来,不是打水漂了(测序后的数据分析质量,决定了文章的水平以及后续验证实验的成功率,小途不才,高通量测序的高级数据分析/多组学整合分析正是在下强项,经我手的SCI没有几万也有几千,哈哈,凡尔赛一下~有需要的小伙伴记得扫码CALL我哦)

 

言归正传,回到今天这篇文章,作者团队筛选出了中医药的有效单体,利用体内外实验,将线粒体、细胞凋亡、缺氧与代谢组整合起来,阐述其作用机制,实属标准案例,分享给大家,一起来学习吧。


研究背景


高原低氧环境可引发认知障碍和高原低氧性脑损伤(HHBI),其机制涉及多方面,核心为线粒体功能障碍。藏药R. crenulate(RCE)对HHBI有脑保护作用,本研究探讨其提取物和成分红景天苷(Salidroside,Sal)对HHBI的治疗潜力,特别是通过保护血脑屏障(BBB)损伤和平衡能量代谢。             


主要研究结果


1.Sal缓解HHBI的损伤

作者对小鼠模型施加RCE和Sal,通过病理染色确认该药物可改善缺氧环境下小数的脑组织病理损伤。
2.RCE和Sal降低HHBI的细胞凋亡    
对缺氧诱导小鼠的脑组织样本进行TUNEL染色,发现RCE和Sal会降低小鼠HHBI的细胞凋亡。
3.血清代谢组学检测
为探究RCE改善缺氧小鼠脑损伤的机制,作者比较了药物处理组和模型组小鼠外周血中的代谢物,发现TCA循环、氨基酸生物合成和抗氧化通路的代谢物存在显著变化。    
   
4.Sal的体外功能验证
研究使用多种染色和成像技术评估了HT22细胞在低氧条件下的凋亡情况,并通过观察线粒体的变化和测量其功能,发现红景天苷(Sal)对低氧诱导的细胞凋亡和线粒体功能障碍具有保护作用,支持其作为神经保护剂的潜力。    
5.Sal介导的MCU对细胞凋亡和线粒体的影响
研究通过WB、荧光探针和成像技术等方法,证明红景天苷(Sal)调节线粒体钙离子和线粒体平衡进而抑制神经元细胞凋亡,活化AMPK/Sirt1途径,保护HT22细胞的低氧胁迫。    
   


文章小结


正如小途前面所提,实际上能筛选出来中药的有效单体,那么整个研究已经成功80%了,后面的具体作用机制走哪条途径,由你的喜好。大不了做一个转录组测序,哪些基因途径有差异,就选哪条途径。喜欢走非编码RNA(miRNA/lncRNA/circRNA等)?走表观遗传(甲基化/乙酰化等)?走细胞死亡(铁死亡/铜死亡/自噬等)?免疫细胞分化(Th1/Th2、Th17/Treg等)?都是分分钟的事情。是不是清晰多了?如果缺乏文章创新思路或者分析技术受限的小伙伴们!可以扫码求助小途哦!

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