library(ggplot2)#建一个散点图pp<-ggplot()+# 创建一个ggplot对象  geom_point(aes(x=1,y=1))+#添加散点图的几何对象  coord_cartesian(clip = "off")#设置坐标系为Cartesian坐标系

ppcowplot::ggdraw()+#创建一个ggdraw对象，用于绘制图形#将之前创建的ggplot对象pp转换为ggplotify对象，#指定旋转角度为-45度。#将前面定义的散点图进行了角度旋转的处理  cowplot::draw_plot(ggplotify::as.ggplot(pp,angle = -45),                     width = 0.5,height = 0.5,#设置绘制图形的宽度和高度为0.5#设置水平和垂直方向的对齐方式                     hjust = -0.2,#                     vjust = -0.5)

library(readxl)#install.packages("rlang")dat<-read_excel("data1.xlsx")dat

#基础library(ggplot2)ggplot(data=dat,aes(x=x,y=y))+#添加热力图的几何对象  geom_tile(aes(fill=log2(value)))+#表示要创建矩形热力图，#fill指定了矩形的颜色映射，使用log2(value)来填充颜色  coord_equal(clip = "off") -> p#设置坐标系为等比例坐标系#clip = "off“表示图形元素可以超出坐标系的范围而不被裁剪p        

#添加文本标签library(tidyverse)dat %>% pull(x) %>% unique()#从数据集dat中提取x列的唯一值p+#添加文本标签的几何对象      geom_text(data=data.frame(x=1:8,y=0:7,#创建了一个新的数据框                            label=dat %>% pull(x) %>% unique()),            aes(x=x,y=y,label=label),angle=90            )+  theme_void() -> p1#将图形的主题设置为空p1

#之前创建的带有文本标签的热力图上添加了两个方框    p1+#geom_path添加路径的几何对象，用于绘制两个方框  geom_path(data=data.frame(x=c(0.5,0.5,4.5,4.5,3.5,3.5,2.5,2.5,1.5,1.5,0.5),#定义方框的形状                            y=c(0.5,4.5,4.5,3.5,3.5,2.5,2.5,1.5,1.5,0.5,0.5)),            aes(x=x,y=y),#指定方框路径的x和y坐标            color="black",size=1)+#设置路径的颜色为黑色，大小为1  geom_path(data=data.frame(x=c(0.5,0.5,4.5,4.5,3.5,3.5,2.5,2.5,1.5,1.5,0.5)+4,                            y=c(0.5,4.5,4.5,3.5,3.5,2.5,2.5,1.5,1.5,0.5,0.5)+4),            aes(x=x,y=y),            color="black",size=1) -> p2p2   

#修改配色###library(ggsci)library(scales) #用来展示颜色## 自然出版集团 (Nature Publishing Group) 风格的颜色方案mypal <- pal_npg("nrc", alpha = 0.7)(10)mypalshow_col(mypal,ncol = 5)#####之前创建的图形（带有两个方框的热力图）进行颜色和主题的调整#scale_fill_gradient2函数调整填充颜色的渐变p2+  scale_fill_gradient2(low = scales::muted("#DC0000B2"),#设置低值颜色为深红色，#使用muted函数调整颜色透明度                       mid = "white",#设置中间值颜色为白色                       high = scales::muted("#3C5488B2"),#设置高值颜色为深蓝色                       midpoint = 0)+#设置颜色变化的中点为0#不显示图例  theme(legend.position = "none") -> p3p3

#额外注释#annotate函数添加线段注释p3+  annotate(geom = "segment",x=0.4,xend=0.4,y=0.5,yend=4.5,#从坐标(0.4, 0.5)到(0.4, 4.5)的线段           size=2,#设置线段的粗细           color="#DC0000B2")+  annotate(geom = "text",               x=0.2,y=2.5,           label="A",#在坐标(0.2, 2.5)处添加文本"A"           angle=45,#设置文本的角度为45度           size=5)+#文本大小为5  annotate(geom = "segment",           x=4.5,xend=8.5,y=8.6,           yend=8.6,           size=2,#置线段的粗细           color="#3C5488B2")+  annotate(geom = "text",           x=6.5,y=8.8,           label="B",#在坐标(6.5, 8.8)处添加文本"B"           angle=45,#置文本的角度为45度           size=5) -> p4p4

#旋转45library(cowplot)ggdraw()+#创建一个ggdraw对象  draw_plot(    ggplotify::as.ggplot(p4,angle = -45),#将之前创建的p4图形转换为ggplot对象，指定旋转角度为-45度            width = 0.7,height = 0.7,#设置插入图形的宽度和高度为0.7#设置插入图形的水平和垂直方向的对齐方式                hjust = -0.2,            vjust = -0.1)+#  annotate(geom = "text",#添加文本注释           x=0.5,y=0.2,           label="Chromatin subcompartments"           ) -> p5
p5

#对之前创建的图形p2进行一些调整p2+  scale_fill_gradient2(low = scales::muted("#DC0000B2"),                       mid = "white",                       high = scales::muted("#3C5488B2"),                       midpoint = 0)+  theme(legend.position = "bottom")+#将图例位置设置在底部  guides(fill=guide_colorbar(title.position = "top",                             title.hjust = 0.5,barwidth = 20)) -> p3.1

p5+  annotation_custom(grob = ggpubr::get_legend(p3.1),#获取p3.1图形的图例                    xmin = 0.1,xmax=0.9,#置插入图例的水平位置范围                    ymin=0.1,ymax=0.2#设置插入图例的垂直位置范围                    )-> p6
p6

#多个library(patchwork)
p6+p6