「付费」【代码-3】与小果一起探索，免疫浸润与多个基因相关性热图绘制
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小果大讲堂又来啦！今天小果想利用通过ssGSEA算法获得的免疫细胞矩阵，以及通过基因表达矩阵提取感兴趣目标基因集表达量，来计算目标基因集与免疫浸润的相关性并计算pvalue，然后将结果用热图的形式表现出来，评价基因对免疫浸润的影响，筛选影响免疫浸润的候选基因，该分析在生信分析文章中出现的比例很高，安利小伙伴可以学习一下该分析，使自己的文章内容变得更加丰富多彩一点，话不多说，赶紧跟着小果开启今天的充电学习时间吧！
ssGSEA算法简单介绍
在进行高颜值的相关性热图绘制之前，小果想带着小伙伴了解一下免疫浸润ssGSEA分析方法的原理和分析结果包含的内容，因为只有在获得ssGSEA结果文件我们才能进行与感兴趣基因集相关性分析，接下来小果为大家来做一个简单的介绍吧！
ssGSEA单样本基因富集分析，是针对单个样本无法做GSEA而设计的，它可以使用GSVA R包来实现，目前ssGSEA常被用来评估肿瘤免疫细胞浸润程度，今天小果就不展示如何利用该包进行ssGSEA分析，有这方面分析需要的小伙伴可以联系小果。
准备需要的R包
install.packages("ggplot2")install.packages("tidyverse")install.packages("ggrepel")install.packages("corrplot")install.pachages("reshape2")
如果需要完整的代码可以点击付费获取哦!今天小果的分享就到这里，如果小伙伴有其他数据分析需求，可以尝试本公司新开发的生信分析小工具云平台，季代码完成分析，非常方便奥!
云平台网址为: http://www.biocloudservice.com/home.html，包括根据gsva结果绘制绘制两基因相关性 图(http://www.biocloudservice.com/405/405.php),根 据 gsva 筛 选高相关性基因(http://www.biocloudservice.com/404/404.php)等小工具，欢迎小伙伴们来尝试哟!
（扫码领取整理好的输入文件，代码文件及示例结果）