2024-06-16

别再只发孟德尔随机化了！联合UK Biobank才是王道！北大深圳医院黄晓彦团队，这篇13+纯生信，可重复性极高！

小果生信果 2024-05-21 19:00:38

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作为临床医生的你们，平时有没有这样的抱怨“门诊、手术已经很忙了，还要为发文章而愁”，每每听到小伙伴这样说，馆长也只能心疼两秒钟，可是怎么办呢？工作不能丢，文章还是要发~但是馆长可以帮小伙伴们解决没时间发文章的尴尬局面，孟德尔随机化就是一个非常好的选择！

今天带来一篇高分文章，来自北大深圳医院黄晓彦团队，该团队利用英国生物库的庞大数据库，通过单样本MR和观察性分析的联合应用，成功揭示了低eGFR与全因死亡率、心血管死亡率、癌症死亡率、感染死亡率和其他原因死亡率之间的线性因果关系。通过单样本MR，能够更准确地评估遗传变异与健康结果之间的关系，从而避免了环境混淆因素的干扰。此外，联合观察性分析进一步增强了研究的全面性和可靠性。Ps：大数据时代，科研人拿公开数据，发自己的文章！数据挖掘就应当提上日程，想感受手握大把数据的朋友，速速扫码联系馆长吧！

题目：肾功能指标与死亡率：孟德尔随机化研究

杂志：Am J Kidney Dis

影响因子：IF=13.2

发表时间：2023年12月

研究背景

肾脏是维持人体内环境稳定的重要器官，负责清除代谢废物、多余水分和电解质。肾小球滤过率（GFR）是评估肾功能的一个重要指标，反映了肾脏清除血液中某些物质的能力。全球人口老龄化加剧了低eGFR的发病率，以及由此带来的社会经济压力。研究显示，随着eGFR的下降，全因死亡率和心血管疾病死亡率有上升趋势，这种相关性即便在控制了混杂因素后依然显著。本研究旨在评估低eGFR与全因死亡率和因特异性死亡率的因果关系。

数据库

数据库	数据类型	详细信息
UKB	个人全部信息	436,214名白人参与者（54.3%女性，平均年龄56.8 ± 8.0岁）的个体数据。

研究结果

1、基线特征

这项研究共包括436214名参与者。表1显示了不同EGFR囊肿类别的研究人群在插补前后的基线特征。

2、随访结果

该研究的中位随访期为12.1年（四分位间距11.4-12.8年）。共有30,489名（7.0%）参与者去世，其中6,098名（1.4%）、15,538名（3.6%）、1,516名（0.3%）和7,227名（1.7%）分别因心血管、癌症、感染和其他原因导致的致命事件。相应的死亡率分别为每100,000人年589人、118人、300人、30人和140人。

3、传统观察分析

Cox比例风险模型的结果显示，较低的eGFRcyst与所有原因死亡、心血管死亡、癌症死亡、感染死亡和其他原因死亡的风险增加相关。

4、遗传工具和假设

按照图1所示，分别使用了35、25、31、18和23个SNPs来构建遗传工具，以评估eGFRcyst与所有原因死亡、心血管死亡、癌症死亡、感染死亡和其他死亡之间的因果关系。

在探索性分析中，分别使用了27、16、18、15和20个SNPs来构建遗传工具，以研究logUACR与所有原因死亡、心血管死亡、癌症死亡、感染死亡和其他死亡之间的因果关系。

图1、等位基因评分作为五种结果的遗传工具的发展过程

5、线性MR分析

为了估计eGFRcyst与感兴趣结果之间的因果关系，进行了线性MR分析。对于每10 ml/min/1.73 m2的基因预测eGFRcyst降低，心血管死亡风险增加43%（危险比[HR]：1.43；95%置信区间[CI]：1.18-1.75）；然而，所有原因死亡（HR：1.07，95% CI：0.98-1.17）、癌症死亡（HR：1.00，95% CI：0.88-1.14）、感染死亡（HR：0.86，95% CI：0.55-1.33）或其他死亡（HR：0.95，95% CI：0.78-1.16）的风险没有显著增加（图2 A）。

在敏感性分析中，一致地得到了类似的结果（图2 B和表2）。在探索性分析中，也没有发现logUACR与所有原因死亡或任何类型特定原因死亡之间存在显著因果关系（表3）。

图2:eGFR囊肿与五种结果的因果关系

表2、线性孟德尔随机化的灵敏度分析

表3、蛋白尿与五种结果的因果关系

6、非线性MR分析

与观察性研究中的非线性不同，非线性MR分析表明，心血管死亡的风险随着eGFRcyst的下降而线性增加（非线性的P值>0.01）。对于所有原因死亡和非心血管死亡，非线性MR分析显示出非线性趋势，但它们的置信区间较宽。因此，没有足够证据建立eGFRcyst与这些结果之间显著的非线性因果关系（所有非线性的P值均>0.01）。

文章小结

综合来看，这篇论文采用单样本孟德尔随机化分析联合观察性分析方法，深入探索和理解疾病之间的复杂关系，不仅凸显了其独特的优势，更提供了一系列创新的分析工具和组合策略。强烈推荐大家深入研读此文，相信会对你的研究工作产生积极的推动作用。Ps：想复现这种思路欢迎直接扫码联系馆长~

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