可能是最好的生信数据下载软件aspera,小果踩坑合集






可能是最好的生信数据下载软件aspera,小果踩坑合集

小果  生信果  2023-08-21 19:02:53

生信人R语言学习必备

立刻拥有一个Rstudio账号

开启升级模式吧

(56线程,256G内存,个人存储1T)

 


你是不是跟着网上的教程下载了aspera却死活找不到asperaweb_id_dsa.openssh?没错,网上的教程都过时了,大人时代变了。那么废话少说,跟着小果学起来吧。



IBM官网其实写的很清楚了,aspera自4.2版本以后需要使用微软加的OpenSSH,坑爹的IBM还不提供老版本的下载链接。

问题已经清楚了,那么解决方法就有两种:

1:卸载了新版本,使用4.1及以下版本的aspera,中文互联网上可以找到资源,关注小果也能获取资源哦。

2:既然缺了OpenSSH,那就去微软家下载OpenSSH,再把asperaweb_id_dsa.openssh文件弄到就可以了。

首先是OpenSSH的下载:



看教程在设置里面下载即可。


进去后搜索一下下载了OpenSSH没有。可以看到小果已经下载了OpenSSH client,只需要下载OpenSSH server即可。


接下来添加功能里搜索OpenSSH


安装即可。

安装好后需要在服务中设置将启动类型设置为自动。



接下来是asperaweb_id_dsa.openssh文件的获取,首先打开一个txt文件,然后把复制小果的Key,重命名为asperaweb_id_dsa.openssh即可。

-----BEGIN DSA PRIVATE KEY-----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-----END DSA PRIVATE KEY-----


接下来就是aspera下载ENA数据实操:


首先获取ENA数据库ftp下载地址,notepad++打开:



将前缀ftp.sra.ebi.ac.uk改成era-fasp@fasp.sra.ebi.ac.uk:

尝试单条下载:


ascp.exe -T -k 1 -l 100m -i C:UserswccAppDataLocalProgramsIBMAsperaConnectetcasperaweb_id_dsa.openssh  era-fasp@fasp.sra.ebi.ac.uk:/vol1/run/SRR145/SRR14597025/m54181_180811_131943.subreads.bam  F:


其中-i为指定asperaweb_id_dsa.openssh的文件地址,小果这里放在C盘,各位自行更改,

-l 为限制最大传输速度

-T 无需加密传输

-k 断点续传,通常设为1

尝试运行,发现报错信息如下:



这也是很多使用aspera下载常见的问题之一,IBM也亲自进行了解释。总的来说只要加上 -P 33001即可

ascp.exe -T -k 1 -l 100m -P 33001 -i C:UserswccAppDataLocalProgramsIBMAsperaConnectetcasperaweb_id_dsa.openssh era-fasp@fasp.sra.ebi.ac.uk:/vol1/run/SRR145/SRR14597025/m54181_180811_131943.subreads.bam  F:



芜湖,起飞,100Mb/s的下载速度,IBM牛哇!


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