可能是最好的生信数据下载软件aspera,小果踩坑合集
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你是不是跟着网上的教程下载了aspera却死活找不到asperaweb_id_dsa.openssh?没错,网上的教程都过时了,大人时代变了。那么废话少说,跟着小果学起来吧。
IBM官网其实写的很清楚了,aspera自4.2版本以后需要使用微软加的OpenSSH,坑爹的IBM还不提供老版本的下载链接。
问题已经清楚了,那么解决方法就有两种:
1:卸载了新版本,使用4.1及以下版本的aspera,中文互联网上可以找到资源,关注小果也能获取资源哦。
2:既然缺了OpenSSH,那就去微软家下载OpenSSH,再把asperaweb_id_dsa.openssh文件弄到就可以了。
首先是OpenSSH的下载:
看教程在设置里面下载即可。
进去后搜索一下下载了OpenSSH没有。可以看到小果已经下载了OpenSSH client,只需要下载OpenSSH server即可。
接下来添加功能里搜索OpenSSH
安装即可。
安装好后需要在服务中设置将启动类型设置为自动。
接下来是asperaweb_id_dsa.openssh文件的获取,首先打开一个txt文件,然后把复制小果的Key,重命名为asperaweb_id_dsa.openssh即可。
-----BEGIN DSA PRIVATE KEY-----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-----END DSA PRIVATE KEY-----
接下来就是aspera下载ENA数据实操:
首先获取ENA数据库ftp下载地址,notepad++打开:
将前缀ftp.sra.ebi.ac.uk改成era-fasp@fasp.sra.ebi.ac.uk:
尝试单条下载:
ascp.exe -T -k 1 -l 100m -i C:UserswccAppDataLocalProgramsIBMAsperaConnectetcasperaweb_id_dsa.openssh era-fasp@fasp.sra.ebi.ac.uk:/vol1/run/SRR145/SRR14597025/m54181_180811_131943.subreads.bam F:
其中-i为指定asperaweb_id_dsa.openssh的文件地址,小果这里放在C盘,各位自行更改,
-l 为限制最大传输速度
-T 无需加密传输
-k 断点续传,通常设为1
尝试运行,发现报错信息如下:
这也是很多使用aspera下载常见的问题之一,IBM也亲自进行了解释。总的来说只要加上 -P 33001即可
ascp.exe -T -k 1 -l 100m -P 33001 -i C:UserswccAppDataLocalProgramsIBMAsperaConnectetcasperaweb_id_dsa.openssh era-fasp .sra.ebi.ac.uk:/vol1/run/SRR145/SRR14597025/m54181_180811_131943.subreads.bam F:
芜湖,起飞,100Mb/s的下载速度,IBM牛哇!
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