一分钟教会你如何运用R语言包“MASS”






一分钟教会你如何运用R语言包“MASS”

小花  生信果  2023-08-04 19:00:15

点击蓝字 关注我们

R包MASS是R语言中的一个扩展包,全称为”Modern Applied Statistics with S”。该包提供了许多用于现代应用统计学的函数和数据集,是R语言中最受欢迎的扩展包之一。


MASS包包含了多种用于统计建模、数据分析和可视化的函数。以下是一些MASS包的主要功能和特点:

1. 线性模型MASS包提供了一系列用于拟合线性模型的函数,包括lm()函数,可以用于拟合简单和多重线性回归模型。此外,包中还包含了一些用于模型诊断和选择的函数。


2. 广义线性模型:MASS包支持广义线性模型(Generalized Linear Models,GLMs),可以拟合包括二项式回归、泊松回归、负二项式回归等在内的多种模型。


3. 广义可加模型:MASS包提供了用于拟合广义可加模型(Generalized Additive Models,GAMs)的函数。GAMs是一种非线性广义线性模型,允许通过添加平滑函数来建模预测变量与响应变量之间的非线性关系。


4. 主成分分析:MASS包中的prcomp()和principal()函数可以用于进行主成分分析(Principal Component Analysis,PCA),用于降维和数据可视化。


5. 聚类分析:MASS包包含了一些用于聚类分析的函数,如kmeans()函数和hclust()函数,可以用于K均值聚类和层次聚类分析。


6. 正则化:MASS包提供了一些用于正则化的函数,如ridge()函数和lasso()函数。这些函数可以用于拟合正则化的线性模型,以减小过拟合和改善模型的预测性能。


要使用MASS包,可以通过以下代码将其安装和加载到R环境中:

install.packages("MASS")  # 安装MASS包library(MASS)  # 加载MASS包

示例:

线性回归

> library(MASS)> lm_model <- lm(medv ~ ., data = Boston)> summary(lm_model)


主成分分析

> library(MASS)> pca_result <- prcomp(USArrests, scale = TRUE)> summary(pca_result)


K均值聚类

> library(MASS)> kmeans_result <- kmeans(USArrests, centers = 3)> kmeans_result$cluster


广义线性模型

> library(MASS)> data(quine)> quine$AbsentBinary <- ifelse(quine$Days > 10, 1, 0)> glm_model <- glm(cbind(AbsentBinary, 10 - AbsentBinary) ~ ., data = quine, family = binomial)> summary(glm_model)


以上就是对R包MASS的简单介绍啦,它是一个功能强大的统计学扩展包,提供了许多用于数据分析和建模的函数和数据集。无论是进行线性回归、广义线性模型、主成分分析还是聚类分析,MASS包都提供了丰富的工具和函数来支持用户的统计分析工作。


欢迎使用:云生信  – 学生物信息学 (biocloudservice.com)


如果想用服务器可以联系微信:18502195490(快来联系我们使用吧!)



(点击原文跳转)

 点一下阅读原文了解更多资讯