根据 stereopy
官方文档的安装步骤,可以按照以下步骤来安装 stereopy
,确保使用正确的渠道并解决依赖问题。
1. 创建并激活新的 Conda 环境
首先,创建一个新的 Conda 环境并激活:
conda create --name st python=3.8
conda activate st
2. 安装 stereopy
及其依赖
按照官方文档的推荐,使用多个渠道来安装 stereopy
。在环境中运行以下安装命令:
mamba install stereopy -c stereopy -c grst -c numba -c conda-forge -c bioconda -c fastai -c defaults
该命令会从多个渠道(stereopy
, grst
, numba
, conda-forge
, bioconda
, fastai
, defaults
)安装 stereopy
及其所有依赖包。
stereo
包中的 stereo/plots/vt3d_browser/stereopy_3D_browser.py
试图导入 IPython
模块,但是 IPython
未安装,因此导致了 ModuleNotFoundError
错误。
要解决这个问题,只需安装 IPython
模块。可以通过 conda
或 pip
安装:
使用 conda
安装 IPython
mamba install ipython