lncRNA的拷贝数变异下游相关分析(1)

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lncRNA是最近发现的长度超过200 bp的非编码RNA，对发育，分化和代谢很重要，最近的研究表明，lncRNA不仅在组织发育中起重要作用，而且还通过调节基因表达和核转录在癌细胞的增殖和转移中发挥重要作用。拷贝数变异（CNV）在人类基因组中十分普遍，包括缺失，插入，重复和复杂的多位点变异，研究表明CNV与生存有紧密联系。目前已经有多篇多组学纯生信文献将lncRNA与CNV联合起来进行研究，如下：
小编在阅读这些文章时，发现套路十分相近，就连生成的图片几乎都是一个系列的，因此我按照上边文章的套路，整理了lncRNA的CNV分析这一部分的代码，这里我模拟的数据并不是以上文献的，而是其它癌症的，其中基因也是我随机挑选的基因，大家在运行的时候要根据自己的数据适当修改参数啦，另外此流程是针对GISTIC2.0分析的CNV结果文件进行的，所以大家运行前可以先了解下GISTIC2.0软件哈。附件内容包含：(文末有领取链接哦！)
代码测试文件夹：里边是本次分析用到的代码示例数据文件夹：里边是本次流程的输入文件输出结果文件夹：里边是本次流程生成的示例图片readme.txt文件：是对输入文件的说明
问
如何领取代码等文件？
答
文末付费获取网盘链接及提取码~
结果展示
以下是该流程分析出来的图片：
lncRNA的CNV谱在染色体上的定位，内圈和外圈分别表示扩增和缺失
lncRNA的CNV和表达之间相关系数分布频率图
lncRNA的CNV谱在不同样本分组间的热图
lncRNA表达在不同CNV变异组差异分析箱式图 

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